kufunsabg

Genome-wide population genetics and molecular monitoring of insecticide resistance ku Anopheles mosquitoes ku Sebatkilo, Awash, Ethiopia.

Chiyambireni ku Djibouti mu 2012, udzudzu wa ku Asia wotchedwa Anopheles stephensi wafalikira ku Horn of Africa. Kachilomboka kameneka kakufalikirabe ku kontinenti yonse, zomwe zikuwopseza kwambiri mapologalamu oletsa malungo. Njira zoyendetsera ma vector, kuphatikiza maukonde okhala ndi mankhwala ophera tizilombo komanso kupopera mbewu m'nyumba zotsalira, zachepetsa kwambiri malungo. Komabe, kuchuluka kwa udzudzu wosamva tizilombo, kuphatikizapo anopheles stephensi, kukulepheretsa ntchito yothetsa malungo. Kumvetsetsa momwe chiwerengero cha anthu chikuyendera, kutuluka kwa majini pakati pa anthu, ndi kugawa kwa kusintha kwa tizilombo toyambitsa matenda ndikofunikira kuti titsogolere njira zothandizira malungo.
Kuwongolera kumvetsetsa kwathu momwe An. stephensi idakhazikitsidwa mu HOA ndiyofunikira kulosera zomwe zitha kufalikira kumadera atsopano. Ma genetics a anthu akhala akugwiritsidwa ntchito kwambiri pophunzira zamitundu yama vector kuti adziwe za kuchuluka kwa anthu, kusankha kosalekeza, ndi kutuluka kwa majini18,19. Za An. stephensi, kuphunzira kuchuluka kwa anthu komanso kapangidwe ka ma genome kumatha kuthandizira kuwunikira njira yowukira komanso kusinthika kulikonse komwe kungakhaleko kuyambira pomwe idayamba. Kuphatikiza pa kutuluka kwa jini, kusankha ndikofunikira kwambiri chifukwa kumatha kuzindikira ma alleles okhudzana ndi kukana mankhwala ophera tizilombo ndikuwunikira momwe alleles awa akufalikira kudzera mwa anthu20.
Mpaka pano, kuyezetsa zizindikiro za kukana mankhwala ophera tizilombo komanso chibadwa cha anthu mu mitundu yowononga ya Anopheles stephensi kwangotengera majini ochepa chabe. Kutuluka kwa zamoyozi ku Africa sikukumveka bwino, koma lingaliro limodzi ndiloti linayambitsidwa ndi anthu kapena ziweto. Mfundo zina ndi monga kusamuka kwa mtunda wautali ndi mphepo. Zigawo za ku Ethiopia zomwe zidagwiritsidwa ntchito mu kafukufukuyu zidasonkhanitsidwa ku Awash Sebat Kilo, tawuni yomwe ili pamtunda wa 200 km kum'mawa kwa Addis Ababa komanso panjira yayikulu yochokera ku Addis Ababa kupita ku Djibouti. Awash Sebat Kilo ndi dera limene anthu ambiri amadwala malungo ndipo lili ndi anthu ambiri a Anopheles stephensi, omwe akuti samva mankhwala ophera tizilombo, zomwe zimapangitsa kuti likhale lofunika kwambiri pophunzira za chibadwa cha Anopheles stephensi8.
Kusintha kwa mankhwala ophera tizilombo kdr L1014F kunapezeka pafupipafupi ku Ethiopia ndipo sikunapezeke m'magawo aku India. Kusintha kwa kdr kumeneku kumapereka kukana kwa pyrethroids ndi DDT ndipo kudadziwika kale mu An. Chiwerengero cha stephensi chomwe chinasonkhanitsidwa ku India mu 2016 ndi Afghanistan mu 2018.31,32 Ngakhale pali umboni wochuluka wa kukana kwa pyrethroid m'mizinda yonseyi, kusintha kwa kdr L1014F sikunapezeke m'magulu a Mangalore ndi Bangalore omwe adawunikidwa pano. Chiwerengero chochepa cha anthu aku Ethiopia omwe amanyamula SNP iyi omwe anali a heterozygous akuwonetsa kuti kusinthaku kudayamba posachedwapa mwa anthuwa. Izi zimathandizidwa ndi kafukufuku wam'mbuyomu ku Awash omwe sanapeze umboni wa kusintha kwa kdr m'zitsanzo zomwe zinasonkhanitsidwa chaka chisanafike zomwe zafufuzidwa pano.18 Tinazindikira kale kusintha kwa kdr L1014F pafupipafupi pazitsanzo zochokera m'dera lomwelo / chaka pogwiritsa ntchito njira yodziwira amplicon.28 Chifukwa cha kukana kwa phenotypic pa malo owonetserako ma samplings omwe amatsutsana ndi malo otsika kwambiri omwe amatsutsana ndi malo ena owonetserako, mawonekedwe otsika omwe amatsutsana ndi malo ena owonetserako. chifukwa cha phenotype iyi yowonedwa.
Kuchepetsa kwa kafukufukuyu ndikusowa kwa data ya phenotypic pa mayankho ophera tizilombo. Maphunziro owonjezera ophatikizira ma genome sequencing (WGS) kapena kutsata kwama amplicon ophatikizika ndi ma susceptibility bioassays akufunika kuti mufufuze momwe masinthidwewa amakhudzira kuyankha kwa mankhwala. Ma SNP atsopanowa omwe angagwirizane ndi kukana ayenera kuyang'ana pazitsulo zapamwamba za maselo kuti zithandizire kuyang'anira ndikuthandizira ntchito yogwira ntchito kuti amvetsetse ndikutsimikizira njira zomwe zingagwirizane ndi kukana phenotypes.
Mwachidule, kafukufukuyu akupereka kumvetsetsa mozama za chibadwa cha udzudzu wa Anopheles m'makontinenti onse. Kugwiritsa ntchito kusanthula kwa ma genome sequencing (WGS) m'magulu akuluakulu a zitsanzo m'magawo osiyanasiyana kudzakhala kofunikira pakumvetsetsa mayendedwe a majini ndikuzindikiritsa zolembera zokana mankhwala. Kudziwa kumeneku kudzathandiza akuluakulu azaumoyo kuti azisankha mwanzeru pakuwunika ma vector ndi kugwiritsa ntchito mankhwala ophera tizilombo.
Tinagwiritsa ntchito njira ziwiri kuti tipeze kusiyana kwa manambala a kopi mu dataset iyi. Choyamba, tidagwiritsa ntchito njira yowunikira yomwe imayang'ana pamagulu odziwika a CYP mu genome (Supplementary Table S5). Zitsanzo za kufalitsa zidagawidwa m'malo osonkhanitsira ndikugawidwa m'magulu anayi: Ethiopia, minda ya India, madera aku India, ndi madera aku Pakistani. Kufalikira kwa gulu lirilonse kumasinthidwa pogwiritsa ntchito kernel smoothing ndiyeno kukonzedwa molingana ndi kuya kwa ma genome apakati pa gululo.


Nthawi yotumiza: Jun-23-2025